热烈祝贺肖阳获得专业实践一等奖
2025-07-23
肖阳，2022级硕士，2024年1月26日至2024年5月31日在腾讯科技有限公司完成专业实践，获得专业实践一等奖。2025年6月获得清华大学制药工程领域工程硕士专业学位，拟于香港大学计算机系深造。
肖阳师从清华大学深圳国际研究生院刘晓副教授，研究方向为AI大模型在计算免疫学中的应用探索，是新颖的交叉课题。在硕士本专业的培养阶段，他系统学习了免疫学，生物信息学等生物相关的课程。在企业的实习期间，他补齐了人工智能方面的知识，接触到最新的技术前沿，掌握多模态模型构建、结构预测算法等核心技术。这种多学科的知识使其能在交叉领域上攻关。2024年1月，肖阳进入腾讯AI实验室开展专业实践，在校内外导师联合指导下，投身于计算免疫学的前沿课题。
在实践初期，肖阳聚焦行业核心痛点，传统TCR/抗体筛选效率低制约免疫治疗研发。他创新提出多模态深度学习解决方案，开发了Multimodal-AIR-BERT模型，通过门控注意力机制动态融合V(D)J基因编码与CDR3序列的3-mer分词特征，突破传统二分类预测局限，实现TCR的特异性与结合强度的量化预测。该模型在10xPBMC-TCR数据集上取得抗原分类AUC 0.917、亲和力预测皮尔逊相关系数0.89的SOTA效果，相关论文被IEEE BIBM 2023（CCFB）收录，并在IEEE生物信息学与生物医学国际会议（伊斯坦布尔）做了口头汇报。
针对TCR-pMHC结构预测精度与速度不足的行业难题，肖阳在腾讯导师的指导下作为tfold-TCR团队的核心成员参与了新型算法的部分设计工作。tfold-TCR团队设计了TCR与pMHC单体预测模块和复合物融合模块，结合ESM-PPI语言模型提取特征代替Alphafold的MSA（多重序列比对）模块，成功将单样本预测时间从2小时压缩至6秒，效率获得有效提升。tfold-TCR团队构建的TCRStructDB数据库（含三百多万预测结构，并开发配套分析平台，实现结构预测、结合序列查询，相似序列搜寻等流程的智能化），获领域内多位知名学者高度评价。
在抗体研发周期长、成本高的攻坚战中，肖阳参与设计了基于序列和结构协同设计的模型，并完成了超高通量的AI设计抗体筛选工作，生成结果得到湿实验的验证，属于干湿实验结合研究的重大突破，在多个靶点上获得高亲和力抗体。
在专业实践中，肖阳深刻认识到计算免疫学在精准医疗中的战略价值。tfoldTCR团队研发的AI模型使TCR结构预测成本大大降低；其次，tfoldTCR团队开发的TCRStructDB网站收到了数千次的点击和访问;最后，tfold团队开发的方法使抗体研发周期缩短超80%。其成果形成一篇会议文章，多篇在审稿中的期刊文章，以及申请专利一项。
肖阳表示：“这段实践经历让我深刻体会到，AI不仅是技术工具，更是破解生命科学难题的新范式。感谢清华与腾讯联合培养平台的支持，让我能将算法创新转化为真实世界的生物医学解决方案”。展望未来，他将继续深耕AI与生物医药交叉领域，致力于开发“从AI设计到实验落地”的全链条系统，为推进健康中国战略贡献青年力量。
校内导师刘晓教授：肖阳展现了出色的跨学科创新能力，其工作既有理论突破，又解决产业重大需求。
腾讯AI实验室赵宇博士：肖阳在实习期间参与了AI for T cell immunology的多项研究，善于团队协作，取得了重大成果。
